Estudios Describen Nuevas Alteraciones en pacientes Pediátricos de Células T – GenomeWeb

NUEVA YORK (GenomeWeb) – Dos nuevos estudios publicados hoy en línea en la revista Nature Genetics han reducido en mutaciones recurrentes y fusiones de genes en pacientes pediátricos de células T leucemia linfoblástica aguda (lla-T), incluyendo alteraciones con vínculos aparentes pediátricos T-TODOS los resultados de los pacientes.

Para uno de los estudios, Saint Jude Children’s Research Hospital patología investigador Charles Mullighan llevó a un grupo de colaboradores de la de San Judas-la Universidad de Washington Proyecto del Genoma del Cáncer Pediátrico, Children’s Oncology Group (COG), y el Instituto Nacional del Cáncer Terapéuticamente Aplicable la Investigación para Generar Tratamientos Eficaces proyecto que utiliza la secuenciación del exoma, basadas en la matriz de genotipado y secuenciación de ARN para el perfil de diagnóstico de tumor y/o remisión de las muestras de 264 niños o adultos jóvenes inscritos en una pieza de prueba entre el 2007 y el 2011.

Esos datos, junto con secuencias completas del genoma 25 de los casos desenterrado más de 100 aparente controlador de genes, junto con 10 de las vías que eran propensos a la recurrente que codifiquen o no de alteraciones tales como la vía de señalización JAK-STAT, Ras, y PTEN-PI3 quinasa vías de señalización. Estos incluyen los genes y procesos implicados en pacientes pediátricos con lla-T en el pasado, así como las alteraciones que parece ser específica para un determinado T-TODOS subtipo o etapa de la enfermedad.

«A pesar de que muchas de las mutaciones más frecuentes en T-TODOS se han descrito anteriormente,» Mullighan y co-autores escribieron, «nuestro sistema integrado de análisis genómico de una gran cohorte de T-TODOS los casos se identificó un gran número de reconocido objetivos de la mutación y demostró etapa y el subtipo específico de las asociaciones entre los genes, las vías celulares, y los resultados».

El uso integrado de datos de genómica y secuenciación específica, los miembros de ese equipo también se considera todo lo arriesgado de mutaciones de línea germinal en el T-TODOS los pacientes a los frecuentes fusiones de genes, cambios regulatorios, o pronóstica informativo tumor alteraciones.

«La multi-modalidad de análisis genómico a cabo para todos los casos permite un análisis detallado de las asociaciones entre genes mutados y subtipos de TODOS los que se consideran a surgir en etapas definidas de desarrollo del timo,» los autores de ese estudio concluyó, señalando que «la imagen detallada de la T-TODOS paisaje genómico ofrece una base racional para el diseño de modelos genéticos de la T-TODO lo que reflejan fielmente la enfermedad humana.»

Por su parte, investigadores de la Universidad de Tokio, la Universidad de Hiroshima, de la Escuela de Posgrado de Ciencias Biomédicas, y otros centros en Japón reunió selectivos de captura de la secuencia, la secuencia de ARN, RT-PCR y/o el número de copias de datos para 181 T-TODOS los casos clasificados como tratamiento refractario o en recaída.

Basado en la secuenciación del transcriptoma de datos de 121 casos, el equipo rastreó recurrente fusiones que involucran la SPI1 factor de transcripción del gen que codifica. Las incluidas fusiones entre el STMN1 gen y SPI1, que inicialmente se encuentra en dos de los casos, y un TCF7-SPI1 de fusión que apareció en tres de los pediatras de T-ALLs.

El uso dirigido de RT-PCR en otro 60 pediátricos T-TODOS los casos, los investigadores encontraron dos más STMN1-SPI1 fusiones, llevando la cuenta de la SPI1 fusiones de genes hasta siete casos o casi el 4 por ciento de los pediatras de T-ALLs perfilados. Y con la adición de la expresión, número de copias, y la secuencia de datos que abarca 158 genes relacionados con el cáncer, que tiene un claro vistazo a otro de los cambios que acompaña a estas fusiones.

Por ejemplo, el equipo observó que los casos marcados por la SPI1 fusiones de genes tienden a caer en la T-TODOS los subtipos con los más pobres de lo habitual, la supervivencia de los patrones, y había patrones de expresión génica haciendo alusión a una alteración de las células T en desarrollo.

«A lo mejor de nuestro conocimiento, estos son los primeros lesiones genéticas asociadas con un pronóstico muy pobre en pacientes pediátricos con lla-T, aunque su impacto sobre la supervivencia debe ser confirmado en otros casos,» Kyoto investigador de la Universidad de Junko Takita y la Universidad de Tokio, Seishi Ogawa, el estudio de la co-autores de los mismos, y sus colegas concluyeron. «T-TODO en pacientes con SPI1 fusiones parece ser incurable con la quimioterapia estándar, lo que subraya la importancia de la detección de este subgrupo de pacientes, para que puedan recibir más intensivos o terapias alternativas.»

ALTERNATIVE THERAPIES TERAPIAS ALTERNATIVAS

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